Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TWIST1Q15672 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms