Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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