Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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