Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRRQ15256 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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