Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDK5R1Q15078 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms