Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3GAP1Q15042 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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RAB3GAP1Q15042 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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