Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP5Q14D33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms