Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMC1AQ14683 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMC1AQ14683 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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