Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PKP1Q13835 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PKP1Q13835 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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