Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHROOM2Q13796 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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SHROOM2Q13796 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHROOM2Q13796 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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