Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TUBA3CQ13748 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TUBA3CQ13748 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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