Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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