Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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