Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPA4Q13156 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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