Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP4Q13115 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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