Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CHAF1BQ13112 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHAF1BQ13112 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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