Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHAF1AQ13111 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHAF1AQ13111 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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