Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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