Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
STRN3Q13033 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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