Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms