Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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