Protein–RNA interactions for Protein: Q12962

TAF10, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF10Q12962 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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TAF10Q12962 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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TAF10Q12962 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF10Q12962 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF10Q12962 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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