Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FOXC1Q12948 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXC1Q12948 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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