Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms