Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB40BQ12829 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms