Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXO1Q12778 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms