Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CD300CQ08708 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms