Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms