Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNB2Q08289 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms