Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DHX9Q08211 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DHX9Q08211 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms