Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SRSF4Q08170 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms