Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms