Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms