Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms