Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID5AQ03989 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms