Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNTN2Q02246 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms