Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF9Q00978 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms