Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLTCQ00610 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms