Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELF3P78545 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELF3P78545 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELF3P78545 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELF3P78545 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms