Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms