Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EEF1A1P68104 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms