Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ABCE1P61221 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCE1P61221 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms