Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DCDC1P59894 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms