Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms