Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME5P56597 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME5P56597 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME5P56597 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME5P56597 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME5P56597 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms