Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRISP1P54107 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms