Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms