Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
APOBEC1P41238 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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