Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARL4AP40617 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms