Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TGFBR1P36897 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms